自治区乡镇企业局                            自治区农机局

    自治区农业干部学校                          农场管理局

    农经管理局                                     农业产业化经营办公室

    自治区农业资源区划办公室                       机关服务中心

    农业技术推广总站                               种子管理总站

    国家农作物原种场                               南繁办公室

    植物保护站                                     农药管理检定所

    土壤肥料工作站                                 农业广播电视学校

    农业信息中心                                   编译室

    农村能源工作站                                 农业环境监测站

    区划资源资料库                                 新疆农业职业技术学院

    哈密植检站                                     鄯善瓜所 

    和田蚕科所                                     伊犁麦检站

    蜂业发展中心                                   棉  办 

    优农中心                                       绿  办